大邑縣疾病預防控制中心成立于2002年11月，是縣政府舉辦的實施疾病預防控制與公共衛生技術管理和服務的公益一類事業單位，四川省二級甲等疾控機構，隸屬于大邑縣衛生健康局，在縣衛健局的直接領導下負責履行疾病預防控制職能，是全縣疾病預防控制、公共衛生技術指導中心，是實施政府行為，帶有社會公益性質，能夠承擔法律責任的實體。
中心現占地30.05畝，建筑面積3200㎡，中心下設10個科室：辦公室（總務科）、黨群辦、財務科、地病消殺滅科、衛生科、性病艾滋病（結核病）科、慢病健教科、傳防免規科、應急質控科、檢驗科。中心核定編制87人，現有在編職工68人，其中衛生專業技術人員47人，高級職稱6人，中級職稱27人。
2015年3月，中心取得食品檢驗機構資質認定證書和實驗室計量認證證書，2018年1月順利通過檢驗檢測機構資質認定復評審，2018年12月順利通過擴項評審，2019年實現血吸蟲病消除達標并成功創建二級甲等疾控機構，2023年成功創建省級慢病示范區。
2020年被成都市評為新冠肺炎疫疫情防控“工人先鋒號”、成都市抗擊新冠肺炎疫情先進集體；2021年四川省慢性病防控工作綜合評估死因監測評估先進單位。
